磁混凝工艺最大的特点是大大缩短了混凝沉淀的时间，传统的混凝沉淀至少需要1h以上，而引用磁混凝工艺进行的混凝沉淀总时间在15min以下，甚至可以在7 min以内完成。磁混凝工艺是一种极沉淀技术，以投加微米级惰性高密度微粒（微砂Fe3O4作为絮凝核，在较优水力条件下形成高浓度和大密度复合絮体，该复合絮体在极短时间完成沉淀过程，使水体迅速得到净化，能够有效去除COD、总磷、氨氮等污染物质，提供更好的出水水质。
目前，面对土地资源越来越紧缺，水源水资源污染加重，水厂基建，运行费用高等问题，采用磁混凝工艺能够很好的解决这些问题，磁混凝工艺主要是利用絮体与磁粉微粒的结合，使絮体密度得到提高，对于相对密度为2.65g/cm3磁粉絮体1.05/cm3的常规絮体，前者的沉淀速率约为后者的 5-10倍，从而可以显著减少絮凝反应沉淀池的占地面积极，采用磁混凝池单位占地面积极仅为 80-120m2/万m3。
磁混凝工艺能有效解决分散供水现状，满足生活用水要求。在经济不发达的广大农村地区，建设净水厂不经济，可采用移动式的磁混凝工艺设备进行供水，对突发性水质恶化情况，可采用磁混凝工艺设备进行紧急供水，对于野外作业，可采用磁混凝工艺设备进行供水。
国家对污水排放标准要求越来越高，在污水二级处理不达标的情况下，可采用磁混凝工艺进行三级处理，可有效提高出水水质，减少占地，降低建设和运行成本。